申根短期商务签证是欧盟成员国为了方便商务人士在本区域内流动而设立的一种签证类型。如果你持有申根短期商务签证，但最终没有前往签证申请时所声称的目的地，而是选择留在国内或其他地方，这是否会有影响取决于多个因素。

签证有效期与入境次数：短期申根商务签证通常的有效期较短，一般在3-90天内。同时，根据签证类型，有些是单次入境，有些是多次入境。如果在签证有效期内没有前往申根国家，那么签证自动失效，对下次申请可能产生一定的影响。

签证诚实原则：申根签证申请过程中需要提供详细的行程计划、住宿地点等真实信息。如果申请人故意隐瞒真实目的或提供虚假信息，这不仅会被拒签，还会对今后的任何申根签证申请产生严重的负面效果。

后果的严重性：每个国家对不遵守签证规定的情形有不同的处理方式。有些人可能被要求缴纳罚款或面临一段时间内无法再次申请申根签证的惩罚。更严重的情况可能会导致永久拒签。

无论何种原因未能履行签证申请时的承诺，都不应被视为小事。尤其是当计划再次申请申根签证或其他国家签证时，之前的任何不诚实行为都可能成为被拒签的理由。因此，建议在签证申请时务必提供真实信息并按照承诺的行程计划旅行，以避免不必要的麻烦。